Мини-футбольный клуб "Сибиряк" был создан в 1988 году. Первое его достижение последовало уже в следующем году — победа во всесоюзном турнире на приз газеты "Комсомольская правда". В 1991 году команда приняла участие в единственном чемпионате СССР по мини-футболу и заняла 9-ое место.
Следующие 7 сезонов новосибирцы провели в элите российского мини-футбола, по результатам сезона-1998 покинули её, но уже через год вернулись обратно. Ещё два сезона в Высшей Лиге (раньше такое название носила Суперлига) — и команда вновь понижается в классе, но на этот раз быстрого возвращения не получилось. Отыграв 5 сезонов во втором эшелоне российского мини-футбола, в 2006 году "Сибиряк" прекратил своё существование.
Однако, в 2008 году администрация Новосибирской области приняла решение о возрождении команды, и "Сибиряк" взял старт в Высшей Лиге. Выиграв первенство, новосибирцы сумели добиться повышения в классе.
Сезон 2009/10 они начали в Суперлиге под руководством Темура Алекберова, одного из самых именитых игроков в истории российского мини-футбола. В первом же сезоне "Сибиряк" ворвался в верхнюю половину турнирной таблицы, заняв шестое место.
А по результатам чемпионата 2010/11 новосибирская команда показала ещё более высокий результат — выиграв бронзовые медали. В сезоне 2011/2012 команде удалось взять уже серебряные медали.
Серебряный призер чемпионата России по мини-футболу: 2011-2012
Бронзовый призер чемпионата России по мини-футболу: 2010-2011, 2013-2014, 2014-2015
Победитель всесоюзного турнира на приз газеты "Комсомольская правда" (1989)
Призер турниров в Днепропетровске, Кишиневе и др. городах
Победитель международных турниров в Польше и Болгарии (1990)
В 1991 г. команда принимала участие в финальном турнире Кубка СССР
Победитель Высшей Лиги (Сезон 2008-2009)
Победитель турнира Balticflora Open Cup 2010
Победитель турнира "Кубок Урала" 2011, 2013